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如何用UV法测定DNA浓度?

DNA浓度的准确测定是分子生物学、遗传学、医学诊断与生物制药等领域实验操作的基础环节。紫外分光光度法(UV-Vis)以其简便、快速、无损的优势成为常规DNA定量的重要方法。

1. 引言

DNA提取与纯化是现代分子生物学实验体系的起点,而准确评估提取产物中的DNA浓度与纯度是后续实验设计与数据可靠性的前提。紫外分光光度法作为无损定量分析技术,已成为绝大多数实验室日常检测DNA浓度的首选方法之一。与荧光染料法、电泳半定量法相比,UV法以操作便捷、成本低、检测快速而受到广泛青睐。尽管原理简单,但影响DNA紫外测定准确性的因素复杂,需系统性掌握其技术内涵。


2. 紫外分光光度法的原理基础

2.1 DNA的紫外吸收特性

DNA分子中嘌呤(A、G)、嘧啶(C、T)碱基含有大量共轭双键体系,形成稳定π-π*跃迁吸收:

  • 最大吸收波长 λmax ≈ 260 nm

  • 主要贡献来自碱基芳香环;

  • 脱氧核糖与磷酸骨架对吸光影响极小。

2.2 朗伯-比尔定律在DNA定量中的应用

DNA溶液的吸光度A在260 nm波长下与其浓度成正比:

A=ε⋅c⋅lA = \varepsilon \cdot c \cdot lA=εcl

其中:

  • A:吸光度;

  • ε:摩尔吸光系数(与核酸类型有关);

  • c:浓度;

  • l:光程(一般为1 cm)。


3. UV法测定DNA浓度的操作流程

3.1 样品准备

  • 样品溶液应透明、无明显混浊;

  • 若DNA浓度过高,可稀释至吸光度介于0.1~1.0 A之间;

  • 常用缓冲液:TE缓冲液、无RNA酶水、10 mM Tris-HCl (pH 7.5~8.0)。

3.2 仪器准备

  • 紫外分光光度计波长设置:260 nm;

  • 使用石英比色皿(普通玻璃吸收UV);

  • 比色皿内壁无划痕、无气泡。

3.3 测定步骤

  1. 以纯缓冲液为空白进行调零;

  2. 将待测DNA溶液置入比色皿;

  3. 读取A260吸光度值;

  4. 同时记录A280、A230吸光度用于纯度评估;

  5. 记录数据并进行浓度计算。


4. DNA浓度计算方法

4.1 吸光度与浓度换算系数

按照国际通用标准:

  • dsDNA(双链DNA):

    CdsDNA(μg/mL)=A260×50C_{dsDNA} (\mu g/mL) = A_{260} \times 50CdsDNA(μg/mL)=A260×50

    • 1 A260 对应浓度为 50 μg/mL;

    • 计算公式:

  • ssDNA(单链DNA):

    CssDNA(μg/mL)=A260×33C_{ssDNA} (\mu g/mL) = A_{260} \times 33CssDNA(μg/mL)=A260×33

    • 1 A260 对应浓度为 33 μg/mL;

    • 计算公式:

  • RNA:

    • 1 A260 对应 40 μg/mL;

    • 用于区分RNA污染成分。

4.2 实例计算

某DNA溶液A260 = 0.85:

  • 若为双链DNA,则:

浓度=0.85×50=42.5μg/mL浓度 = 0.85 \times 50 = 42.5 \mu g/mL浓度=0.85×50=42.5μg/mL

4.3 稀释倍数换算

若样品稀释10倍后测得A260:

  • 原液浓度 = 42.5 μg/mL × 10 = 425 μg/mL。


5. DNA纯度评估——A260/A280比值

5.1 蛋白污染检测

  • 蛋白质最大吸收波长 λmax ≈ 280 nm(主要来自酪氨酸、色氨酸);

  • 以A260/A280比值评价纯度;

  • 理想值为 1.8~2.0(双链DNA最佳区间);

  • 比值低于 1.8,提示蛋白或酚类污染;

  • 比值高于 2.0,可能存在RNA或小分子有机物干扰。

5.2 A230吸收干扰

  • A230反映盐、酚、碳水化合物污染;

  • A260/A230理想值为 2.0~2.2;

  • 低于此值可能提示有机物残留。


6. UV法DNA定量的优势与适用范围

6.1 优势

  • 样品无需染料标记;

  • 无损检测,样品可重复使用;

  • 操作简单、快速(约5分钟内完成);

  • 适用于高浓度DNA初筛、质控监测。

6.2 适用范围

  • 纯化DNA浓度初步估算;

  • PCR、克隆、测序前模板浓度标准化;

  • 病毒载体、质粒制备工艺控制;

  • 实验室日常常规核酸样品浓度检测。


7. UV法DNA定量的局限性与误差来源

7.1 灵敏度局限

  • 检出限较高(一般 >2 μg/mL);

  • 低浓度DNA测定误差显著上升;

  • 不适合痕量样本分析

7.2 纯度干扰

  • 蛋白质、酚、RNA残留影响吸光度;

  • 多组分重叠吸收导致误判。

7.3 溶剂背景吸收

  • 水、缓冲盐浓度、pH值影响背景吸光度;

  • 比色皿污染、指纹污渍产生光散射偏差。

7.4 dsDNA与ssDNA误差

  • UV法无法区分单双链DNA;

  • 适用吸收系数不同导致误差;

  • 某些退火、解链样品需明确链型状态。

7.5 氧化产物吸收

  • 存储不当DNA氧化断裂后吸收曲线变化;

  • 增加A230背景吸收。


8. UV法与荧光染料法对比

指标紫外分光光度法荧光染料法
灵敏度μg/mLng/mL级甚至pg/mL
专一性高(结合DNA专一位点)
操作复杂度简单需染料与标准曲线
适用浓度区间高中浓度极低浓度
成本染料成本高
样品消耗无损染料消耗样品一部分

结论:UV法适用于纯化后DNA初步浓度评估;荧光法适合痕量DNA精准定量。


9. 紫外分光光度计性能要求与仪器选择

9.1 波长精度

  • 精度 ≤ ±1 nm;

  • 保证260 nm测定波长准确性。

9.2 吸光度线性范围

  • 推荐 0.1~1.5 A 区间;

  • 吸光度过高时需稀释检测。

9.3 比色皿选择

  • 石英比色皿(190~1100 nm);

  • 光程1 cm(标准);

  • 微量检测可选用微量比色皿(如NanoDrop平台)。

9.4 微量DNA检测平台

  • 微量样本体积 1~2 μL;

  • 无需标准比色皿;

  • 避免样品稀释误差;

  • 适合痕量核酸定量。


10. UV法DNA定量中的常见问题与解决策略

问题表现可能原因解决办法
A260/A280 比值低蛋白、酚污染重复酚/氯仿提取、乙醇沉淀净化
A260/A230 比值低盐、碳水残留重新乙醇沉淀、柱纯化
吸光度异常高比色皿污渍彻底清洗比色皿
低浓度波动大信号接近仪器检出限样品浓缩或换用荧光法
A260 > 2.0可能RNA污染酶消化去RNA后复测

11. UV法DNA定量的发展趋势

11.1 自动化微量平台集成

  • 微量样本输入;

  • 自动背景校正;

  • 批量连续分析;

  • 数据自动输出。

11.2 AI算法辅助纠偏

  • 自动识别谱图异常;

  • 误差自学习模型;

  • 提高复杂样品纯度评估准确性。

11.3 多波长修正算法

  • 多波段联合拟合;

  • 更精准校正杂质吸收;

  • 适用于复杂生物样品分析

11.4 智能便携式设备

  • 现场即时核酸定量;

  • 云平台远程监控;

  • 集成到分子诊断设备模块中。


12. 结语

紫外分光光度法因其无损、快速、便捷等优势,已成为DNA浓度测定中应用最广泛的标准方法之一。虽然在灵敏度与特异性上存在一定局限,但在日常核酸提取、质控检测、常规浓度评估等场景中依然具备不可替代的应用价值。随着检测技术平台化、智能化与数据驱动分析的发展,UV法DNA定量将在实验室自动化管理体系中扮演更为重要的技术支撑角色。