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如何用UV法测定DNA浓度?

DNA浓度的准确测定是分子生物学、医学诊断、生物制药及遗传工程等领域实验工作的基础。紫外分光光度法(UV法)作为一种经典的光谱分析技术,因其操作简便、速度快、成本低、无损耗等优点,广泛应用于DNA浓度的快速定量分析中。

1. 引言

DNA的提取与纯化是各类分子生物学实验的前提,准确测定DNA浓度对于下游实验(如PCR扩增、测序、克隆、转染、芯片杂交等)设计和结果的可靠性至关重要。UV分光光度法因其简洁、高效,成为最常用的DNA浓度测定技术之一,尤其适合于实验室日常样品初步定量和质控检测。


2. 紫外分光光度法测定DNA浓度的基本原理

2.1 DNA的紫外吸收特性

DNA分子中的碱基部分富含共轭双键,尤其是嘌呤(A、G)和嘧啶(C、T)环,能在紫外区产生强烈的π→π*跃迁吸收:

  • DNA最大吸收波长:260 nm

  • 脱氧核糖和磷酸骨架本身不产生紫外吸收。

2.2 朗伯-比尔定律

UV法基于朗伯-比尔定律:

A=ε⋅c⋅lA = \varepsilon \cdot c \cdot lA=εcl

其中:

  • A:吸光度;

  • ε:摩尔吸光系数;

  • c:待测物浓度;

  • l:比色池光程(通常为1 cm)。

在特定条件下,DNA浓度与其在260 nm处的吸光度成线性正比关系。

2.3 DNA类型与吸收系数

样品类型ε 值 (A260对应浓度)
双链DNA(dsDNA)1 A260 = 50 μg/mL
单链DNA(ssDNA)1 A260 = 33 μg/mL
RNA1 A260 = 40 μg/mL

不同核酸类型需选用对应的换算系数。


3. UV法测定DNA浓度的操作流程

3.1 仪器准备

  • 紫外分光光度计

  • 石英比色皿(普通玻璃比色皿不透过紫外光);

  • 波长设置为260 nm(必要时同时检测230 nm、280 nm用于纯度评估)。

3.2 样品准备

  • DNA样品须澄清透明、无沉淀;

  • 样品浓度需稀释至吸光度A260约0.1~1.0范围内;

  • 稀释用液需与空白匹配(如TE缓冲液、无RNA酶水等)。

3.3 测定步骤

  1. 用空白溶液调零;

  2. 加入DNA样品,读取A260值;

  3. 同时记录A280及A230用于纯度分析;

  4. 记录并计算浓度。

3.4 浓度计算示例

假设A260读数为0.75:

对于双链DNA:

浓度=A260×50μg/mL=0.75×50=37.5μg/mL浓度 = A260 \times 50 \mu g/mL = 0.75 \times 50 = 37.5 \mu g/mL浓度=A260×50μg/mL=0.75×50=37.5μg/mL

若样品稀释10倍测定,则原液浓度为375 μg/mL。


4. DNA纯度评估指标

4.1 A260/A280比值

  • 理想值为1.8~2.0;

  • 低于1.8可能存在蛋白或酚类污染;

  • 高于2.0可能存在RNA污染。

4.2 A260/A230比值

  • 理想值为2.0~2.2;

  • 低值提示盐、酚、碳水化合物等杂质干扰。

A260/A280与A260/A230比值是UV法DNA测定中的重要质控指标。


5. UV法DNA浓度测定的优势

优势技术说明
快速高效几分钟即可获得数据
无损耗样品可回收重复使用
设备普及大多数实验室均配备
操作简便无需复杂试剂和化学反应
经济环保耗材成本低,试剂用量少

UV法特别适用于DNA纯化过程监控、大量样品批量检测以及PCR前的模板浓度调整。


6. UV法DNA测定的局限性

局限性技术表现解决对策
灵敏度有限检出限高于2 μg/mL微量样品采用荧光法
纯度干扰共存蛋白、RNA、盐类吸收叠加增加纯化步骤,合理比值控制
不能区分单双链ssDNA吸光系数不同明确核酸类型,选用正确系数
吸收饱和高浓度吸光度超出线性区适当稀释样品
溶剂干扰pH和盐浓度影响吸光使用统一缓冲液做空白

7. UV法测定DNA浓度常见误差来源

7.1 比色皿污染

  • 水渍、指纹、划痕均会产生光散射误差;

  • 清洗干净并正确握持比色皿非常重要。

7.2 样品气泡

  • 微气泡导致测定不稳定;

  • 需轻轻甩动样品消除气泡。

7.3 比色皿位置偏移

  • 放置不平稳会影响光路一致性;

  • 每次检测保证比色皿固定对中。

7.4 稀释误差

  • 移液器使用准确性直接影响稀释浓度;

  • 建议使用校准良好的微量移液器。


8. UV法与荧光法在DNA定量中的对比

指标UV法荧光法
灵敏度μg/mL 级ng/mL 级甚至pg/mL
选择性高(可区分DNA、RNA)
操作简便性非常高略复杂
试剂依赖性需荧光染料
多样本适用性大量样本适合痕量样本适合
成本投入略高

UV法适用于大部分日常纯化样品浓度评估,而荧光法更适合极低浓度或极高纯度要求的样品。


9. UV法测定DNA浓度的典型应用场景

应用环节主要目的
DNA提取后检测评估提取效率
质粒制备监控确保浓度与纯度达标
PCR模板稀释精确配置扩增体系
测序送样保证上机前质量控制
克隆转化前检测调整转染浓度
病毒载体生产工艺放大纯化质量监控

UV法已成为分子生物学实验室日常运行中的常规标准技术。


10. 紫外分光光度计性能要求

技术指标推荐标准
波长范围190–800 nm
波长精度±0.5 nm
吸光度精度±0.002 A
比色皿材质石英(UV透过性好)
光程配置1 cm 或微量光程(0.05–1 mm)
软件功能吸光度-浓度自动换算、A260/A280/A230比值自动计算

11. UV法DNA定量的未来技术趋势

11.1 微量检测平台

  • 纳米光程池(如NanoDrop);

  • 仅需0.5–2 μL样品;

  • 避免稀释误差;

  • 微量核酸样品分析主流化。

11.2 智能算法建模

  • AI辅助比值判断;

  • 自动识别蛋白污染、盐类污染;

  • 实时质量预警系统。

11.3 UV-荧光融合平台

  • 一体化集成UV与荧光检测

  • 同时输出总量与有效量;

  • 适合高通量自动化平台应用。

11.4 在线过程监控

  • 大规模DNA生产线实时质量监测;

  • 支持核酸药物、基因治疗产业化流程管理。


12. UV法DNA定量标准操作规程简要(SOP)

  1. 仪器开机预热20分钟;

  2. 检查并清洁石英比色皿;

  3. 配制适当浓度样品(吸光度控制在0.1~1.0之间);

  4. 以空白液调零;

  5. 测定A260、A280与A230;

  6. 按照对应公式计算浓度及纯度比值;

  7. 记录数据并出具检测报告。


13. 结语

紫外分光光度法在DNA浓度检测中仍保持着其无可替代的基础性地位。作为一种快速、经济、无损、高效的分析手段,UV法被广泛应用于各类分子生物学实验流程的起始步骤、生产放行环节以及核酸工艺质控体系之中。未来,结合智能算法、微量技术、自动控制与多模式联用,紫外法DNA定量技术将在分子生物学、基因治疗、疫苗研发等新兴生物技术产业中持续焕发新的活力。