浙江栢塑信息技术有限公司

如何用UV法测定DNA浓度?

测 DNA 浓度为什么首选 UV?
速度快 — 上机 1 min 内即可读数;

样品省 — 微量型比色槽 0.5–2 µL 即可;

无标曲 — 大多数情况下可直接用经验换算系数推浓度;

无损耗 — 测完的核酸可回收做下游实验。

因此,虽然荧光染料(PicoGreen、Qubit)灵敏度更高,紫外法仍是“日常快检”和“过程监控”的首选手段。

1 测 DNA 浓度为什么首选 UV?

  • 速度快 — 上机 1 min 内即可读数;

  • 样品省 — 微量型比色槽 0.5–2 µL 即可;

  • 无标曲 — 大多数情况下可直接用经验换算系数推浓度;

  • 无损耗 — 测完的核酸可回收做下游实验。

因此,虽然荧光染料(PicoGreen、Qubit)灵敏度更高,紫外法仍是“日常快检”和“过程监控”的首选手段。


2 DNA 的紫外吸收基础

残基主吸收带机理贡献度
A、G260 nmπ→π*
C、T257 nmπ→π*
脱氧核糖忽略

经验换算系数

  • 双链 DNA:1 A_260 = 50 µg·mL⁻¹

  • 单链 DNA:1 A_260 = 33 µg·mL⁻¹

  • RNA:1 A_260 = 40 µg·mL⁻¹

朗伯–比耳定律 A=εclA=\varepsilon c lA=εcl 在 0.1–1.0 A 范围内几乎线性,因此实际测定常把样品稀释到 A_260≈0.2–0.8 之间。


3 仪器与耗材配置清单

类别建议规格说明
紫外分光光度计波长准确度 ≤ 0.5 nm常规或微量型均可
比色池石英材质,光程 1 cm;微量型 0.2–1 mm石英对 190–300 nm 透光率最高
空白溶液TE、纯水或 Tris 低盐缓冲液空白与样品基体保持一致
微量移液器0.5–10 µL、10–100 µL保证稀释准确

4 标准操作流程(SOP)

4.1 预检查

  1. 光源预热 ≥ 15 min;

  2. 空白槽装入匹配溶液,扫描 230–320 nm,确认基线平直;

  3. 波长校验:用 0.02 % K₂Cr₂O₇ 标液,核对 257、313 nm 两点。

4.2 样品处理与稀释

原始样品浓度预估 A_260建议稀释倍数
≤ 100 ng·µL⁻¹< 0.2直接测
100–500 ng·µL⁻¹0.2–1.05–10×
≥ 500 ng·µL⁻¹> 1.0≥ 20×

稀释用缓冲液 pH 7.5–8.5,可减少碱基电离对吸收峰的微移。

4.3 读数步骤

  1. 将空白溶液注入比色池 → 调零;

  2. 取稀释后样品 1 mL(或 2 µL 于微量槽)上机;

  3. 记录 A_260、A_280、A_230 三个吸光度;

  4. 反算原液浓度:

    CdsDNA(μg⋅mL−1)=A260d×50×DC_{\text{dsDNA}}(\mu g·mL^{-1}) =\frac{A_{260}}{d}\times50\times DCdsDNA(μgmL1)=dA260×50×D

    • ddd:光程 (cm);微量槽常为 0.05–0.2 cm

    • DDD:稀释倍数。


5 纯度指标双保险

比值理想范围含义
A_260/A_2801.8–2.0蛋白质或酚污染 ↑→比值↓
A_260/A_2302.0–2.2卡波合物、盐或胍残留 ↑→比值↓

若比值异常,可用如下方式修正:

  • 蛋白污染:酚/氯仿抽提或蛋白酶 K 消化;

  • 盐类残留:75 % 乙醇洗涤并重溶;

  • 胍盐:硅胶柱洗脱增加 TE 缓冲体积。


6 微量光程平台要点

型号光程 (mm)样品体积校准方式
NanoDrop One0.05 / 0.21–2 µL自动折返镜光程
DeNovix DS-110.03–0.50.5–2 µL传感器检测液柱
  • 不必稀释至 0.1–1 A;仪器可自动压缩/延长光程使 A_260 落在量程内;

  • 擦拭方式:测完用无尘纸 + 70 % 乙醇轻拭上下窗口,防止交叉污染;

  • 避免气泡:上下移液枪轻打,保持液滴完整铺展。


7 方法学验证实例

项目结果评价标准
线性10–500 ng·µL⁻¹, R² = 0.9998合格
检出限2 ng·µL⁻¹ (S/N=3)满足常规分子实验
重复性50 ng·µL⁻¹ 六次测定 RSD=1.2 %≤ 2 %
准确度标样 100 ng·µL⁻¹,测值 98.7 ± 1.5 ng·µL⁻¹95–105 %

8 常见“坑点”与快速排查

现象可能原因应对
A_260 读数跳变光斑有气泡换枪头再次上样
比值>2.1RNA 混入加 RNase A 消化重新测
比值<1.6蛋白 or 酚再做酚/氯仿抽提
底噪高比色池脏或光源老化清洗石英面,校验 K₂Cr₂O₇

9 拓展应用

  1. qPCR 模板标准化:将 OD 定量与 Ct 值对照,建立曲线,确保每孔模板量一致。

  2. 文库定量:高通量测序建库前快速评估双链 DNA 产量,结合片段分析可预判上机读长。

  3. 生物制药:mRNA 疫苗工艺开发中,用 UV 法在线监控转录产率与 DNase 消化效率。

  4. 核酸药物质控:ASO/siRNA 车间连续生产,可借流动注射+UV 实现闭环实时浓度调节。


10 结语

  • 通用性:UV 法对纯化核酸样品适用面极广;

  • 局限性:对低浓度或重污染样本灵敏度不足,可辅以荧光染料;

  • 趋势:微流控芯片、在线探针与 AI 异常识别算法将把传统“台式 UV”升级为“智能工艺传感器”,让核酸浓度监控更即时、更自动、更可靠。