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如何用UV法测定DNA浓度?

原理、操作与数据质量控制的系统指南

一、为什么选用紫外法?

无论在基因克隆、测序建库,还是核酸药物生产线上,实验人员几乎每天都要“扫一眼”核酸浓度。与荧光染料法(PicoGreen、Qubit 等)相比,紫外吸收法具备四大优势:

优势说明带来的好处
快速读数不超 60 s有效提高样品周转率
无反应试剂不需要荧光探针或显色剂降低耗材成本、避免二次污染
微样本微光程仪器仅需 1–2 µL保护珍贵样本,用后即可回收
可回溯全谱可存档,后期复核方便发现批次异常时追溯简明

二、核酸的紫外吸收原理

  1. π→π* 电子跃迁:嘌呤(A、G)和嘧啶(C、T)环系在 260 nm 处吸收最强。

  2. ε 值经验系数

    • 双链 DNA:1 A₍₂₆₀₎ 对应 50 µg·mL⁻¹

    • 单链 DNA:1 A₍₂₆₀₎ 对应 33 µg·mL⁻¹

    • RNA:1 A₍₂₆₀₎ 对应 40 µg·mL⁻¹

  3. 吸收遵循朗伯–比耳定律

    A=ε c lA=\varepsilon\,c\,lA=εcl

    在 0.1–1 AU 区间近似线性。


三、设备与耗材配置

项目推荐参数选择理由
UV-Vis 主机波长精度 ≤ 0.5 nm,光度重复性 ≤ 0.005 AU保证定量可靠
比色路径 (l)1 cm 石英槽、0.2 mm 微光程覆盖宽浓度范围
移液器0.5–10 µL、10–100 µL稀释准确,减少系统误差
空白缓冲TE(pH 8.0)、超纯水与样品基体保持一致

四、经典操作步骤

4.1 开机与波长校验

  • 预热光源 ≥ 15 min;

  • 0.02 % K₂Cr₂O₇ 溶液检测 257 和 313 nm 处的 A 比例,若偏差 ≤ ±0.3 %,仪器合格。

4.2 样品前处理

样品类型预估浓度建议稀释倍数注意点
质粒裂解液200–400 ng·µL⁻¹20×去 RNase 后测
PCR 产物20–100无需稀释反应缓冲可做空白
NGS 文库10–50微光程直测避免 EDTA>1 mM

4.3 测量流程

  1. 用空白液调零;

  2. 加样——普通比色槽 1 mL 或微光程 2 µL;

  3. 记录 A₂₆₀、A₂₈₀、A₂₃₀ 三值;

  4. 反推浓度

    C(µg\cdotpmL−1)=A260l×50×DC(\text{µg·mL}^{-1})=\frac{A_{260}}{l}\times 50\times DC(µg\cdotpmL1)=lA260×50×D

    其中 D 为稀释倍数。

  5. 质量判读

    • A₂₆₀/A₂₈₀ 应介于 1.8–2.0(蛋白污染↑→比值↓)。

    • A₂₆₀/A₂₃₀ 应 ≥ 2.0(盐、酚、胍残留↑→比值↓)。


五、数据质量控制

项目目标值检查频次
波长准确度±0.5 nm每周
光度精度1 A 标液偏差 ≤ 1 %每周
线性验证1–500 ng·µL⁻¹,R² ≥ 0.999每半年
方法空白A₂₆₀ ≤ 0.005每天

六、纯度与杂质辨析

  1. 蛋白污染

    • 特征:A₂₆₀/A₂₈₀ < 1.6

    • 解决:蛋白酶 K 消化或酚/氯仿再抽提。

  2. 有机溶剂残留(酚)

    • 特征:A₂₆₀/A₂₃₀ < 1.8

    • 解决:乙醚重洗或硅胶柱净化。

  3. 盐分过高

    • 特征:A₂₆₀/A₂₃₀ 略低 1.8–1.9,且曲线 220–240 nm 抬升

    • 解决:75 % 乙醇洗涤或超滤脱盐。


七、微量测定的特别要点

参数常规 1 cm 槽微光程 (0.05 cm)
浓度适配2–100 ng·µL⁻¹0.05–3000
最小样量≥ 500 µL0.5–2 µL
稀释步骤时常需要多数免稀释
光程校正固定 1 cm仪器自动检出液柱高度

避免气泡、充分铺展 是微量平台最关键的两件事。测完立即用无尘纸 + 70 % 乙醇擦拭窗口,防交叉污染。


八、方法学验证示例(双链 DNA)

指标结果判定标准
线性5–400 ng·µL⁻¹,R² = 0.9998≥ 0.998
精密度50 ng·µL⁻¹ 六次测定 RSD = 1.3 %≤ 2 %
准确度加标回收 97.8–102.4 %95–105 %
检出限2 ng·µL⁻¹(S/N = 3)

九、常见疑难与解决策略

症状可能原因处理办法
A₂₆₀ 跳动气泡或颗粒重新上样,离心或过滤
比值 > 2.1RNA 混入加 RNase A 37 ℃ 15 min
比值 < 1.5蛋白或酚再次酚/氯仿抽提,洗涤
A 浮值无规律光源老化更换氘灯/氙灯
全谱拖尾光散射稀释、换低粘度溶剂

十、紫外定量的扩展应用

场景UV-Vis 作用价值
qPCR 模板标准化快速设定 Ct 匹配浓度降低技术重复
文库片段建库 QCA₂₆₀+电泳双保险节约测序成本
mRNA 疫苗制程在线光纤探头监控转录率实时反馈工艺
CRISPR 体外编辑反应实时读取核酸消耗判定反应终点

十一、智能化未来

  • AI 过滤算法:深度网络自动去除散射与噪声,浓度误差 < 1 %。

  • Lab-on-Chip:微流控整合稀释、检测、数据上云,单次样本 < 20 nL。

  • 手机级 MEMS 光谱仪:在田间或病房即可完成 DNA 定量,配合蓝牙上传 LIMS 系统。

  • Edge-AI 监控:连续发酵产 DNA 酶制剂过程中,边缘运算模块实时预测浓度曲线并调节补料量。


十二、结语

紫外吸收定量法以“最快速、最经济、最少样本损耗”的优势,仍是核酸研究与生产链条中不可或缺的基础工具。只要掌握 正确稀释、比值判读、杂质排查 三大关键,外加 微量光程 & 数据质控 两大加成,即可把 DNA 浓度测定误差控制在 ±2 % 以内,为下游实验提供坚实起点。随着 MEMS、AI 与 IoT 技术持续植入,紫外法将在未来的“智慧实验室”和“连续流生产”场景中焕发新的生命力。