
如何用UV法测定DNA浓度?
一、为什么选用紫外法?
无论在基因克隆、测序建库,还是核酸药物生产线上,实验人员几乎每天都要“扫一眼”核酸浓度。与荧光染料法(PicoGreen、Qubit 等)相比,紫外吸收法具备四大优势:
优势 | 说明 | 带来的好处 |
---|---|---|
快速 | 读数不超 60 s | 有效提高样品周转率 |
无反应试剂 | 不需要荧光探针或显色剂 | 降低耗材成本、避免二次污染 |
微样本 | 微光程仪器仅需 1–2 µL | 保护珍贵样本,用后即可回收 |
可回溯 | 全谱可存档,后期复核方便 | 发现批次异常时追溯简明 |
二、核酸的紫外吸收原理
π→π* 电子跃迁:嘌呤(A、G)和嘧啶(C、T)环系在 260 nm 处吸收最强。
ε 值经验系数:
双链 DNA:1 A₍₂₆₀₎ 对应 50 µg·mL⁻¹
单链 DNA:1 A₍₂₆₀₎ 对应 33 µg·mL⁻¹
RNA:1 A₍₂₆₀₎ 对应 40 µg·mL⁻¹
吸收遵循朗伯–比耳定律
A=ε c lA=\varepsilon\,c\,lA=εcl
在 0.1–1 AU 区间近似线性。
三、设备与耗材配置
项目 | 推荐参数 | 选择理由 |
---|---|---|
UV-Vis 主机 | 波长精度 ≤ 0.5 nm,光度重复性 ≤ 0.005 AU | 保证定量可靠 |
比色路径 (l) | 1 cm 石英槽、0.2 mm 微光程 | 覆盖宽浓度范围 |
移液器 | 0.5–10 µL、10–100 µL | 稀释准确,减少系统误差 |
空白缓冲 | TE(pH 8.0)、超纯水 | 与样品基体保持一致 |
四、经典操作步骤
4.1 开机与波长校验
预热光源 ≥ 15 min;
0.02 % K₂Cr₂O₇ 溶液检测 257 和 313 nm 处的 A 比例,若偏差 ≤ ±0.3 %,仪器合格。
4.2 样品前处理
样品类型 | 预估浓度 | 建议稀释倍数 | 注意点 |
---|---|---|---|
质粒裂解液 | 200–400 ng·µL⁻¹ | 20× | 去 RNase 后测 |
PCR 产物 | 20–100 | 无需稀释 | 反应缓冲可做空白 |
NGS 文库 | 10–50 | 微光程直测 | 避免 EDTA>1 mM |
4.3 测量流程
用空白液调零;
加样——普通比色槽 1 mL 或微光程 2 µL;
记录 A₂₆₀、A₂₈₀、A₂₃₀ 三值;
反推浓度
C(µg\cdotpmL−1)=A260l×50×DC(\text{µg·mL}^{-1})=\frac{A_{260}}{l}\times 50\times DC(µg\cdotpmL−1)=lA260×50×D
其中 D 为稀释倍数。
质量判读
A₂₆₀/A₂₈₀ 应介于 1.8–2.0(蛋白污染↑→比值↓)。
A₂₆₀/A₂₃₀ 应 ≥ 2.0(盐、酚、胍残留↑→比值↓)。
五、数据质量控制
项目 | 目标值 | 检查频次 |
---|---|---|
波长准确度 | ±0.5 nm | 每周 |
光度精度 | 1 A 标液偏差 ≤ 1 % | 每周 |
线性验证 | 1–500 ng·µL⁻¹,R² ≥ 0.999 | 每半年 |
方法空白 | A₂₆₀ ≤ 0.005 | 每天 |
六、纯度与杂质辨析
蛋白污染
特征:A₂₆₀/A₂₈₀ < 1.6
解决:蛋白酶 K 消化或酚/氯仿再抽提。
有机溶剂残留(酚)
特征:A₂₆₀/A₂₃₀ < 1.8
解决:乙醚重洗或硅胶柱净化。
盐分过高
特征:A₂₆₀/A₂₃₀ 略低 1.8–1.9,且曲线 220–240 nm 抬升
解决:75 % 乙醇洗涤或超滤脱盐。
七、微量测定的特别要点
参数 | 常规 1 cm 槽 | 微光程 (0.05 cm) |
---|---|---|
浓度适配 | 2–100 ng·µL⁻¹ | 0.05–3000 |
最小样量 | ≥ 500 µL | 0.5–2 µL |
稀释步骤 | 时常需要 | 多数免稀释 |
光程校正 | 固定 1 cm | 仪器自动检出液柱高度 |
避免气泡、充分铺展 是微量平台最关键的两件事。测完立即用无尘纸 + 70 % 乙醇擦拭窗口,防交叉污染。
八、方法学验证示例(双链 DNA)
指标 | 结果 | 判定标准 |
---|---|---|
线性 | 5–400 ng·µL⁻¹,R² = 0.9998 | ≥ 0.998 |
精密度 | 50 ng·µL⁻¹ 六次测定 RSD = 1.3 % | ≤ 2 % |
准确度 | 加标回收 97.8–102.4 % | 95–105 % |
检出限 | 2 ng·µL⁻¹(S/N = 3) | — |
九、常见疑难与解决策略
症状 | 可能原因 | 处理办法 |
---|---|---|
A₂₆₀ 跳动 | 气泡或颗粒 | 重新上样,离心或过滤 |
比值 > 2.1 | RNA 混入 | 加 RNase A 37 ℃ 15 min |
比值 < 1.5 | 蛋白或酚 | 再次酚/氯仿抽提,洗涤 |
A 浮值无规律 | 光源老化 | 更换氘灯/氙灯 |
全谱拖尾 | 光散射 | 稀释、换低粘度溶剂 |
十、紫外定量的扩展应用
场景 | UV-Vis 作用 | 价值 |
---|---|---|
qPCR 模板标准化 | 快速设定 Ct 匹配浓度 | 降低技术重复 |
文库片段建库 QC | A₂₆₀+电泳双保险 | 节约测序成本 |
mRNA 疫苗制程 | 在线光纤探头监控转录率 | 实时反馈工艺 |
CRISPR 体外编辑 | 反应实时读取核酸消耗 | 判定反应终点 |
十一、智能化未来
AI 过滤算法:深度网络自动去除散射与噪声,浓度误差 < 1 %。
Lab-on-Chip:微流控整合稀释、检测、数据上云,单次样本 < 20 nL。
手机级 MEMS 光谱仪:在田间或病房即可完成 DNA 定量,配合蓝牙上传 LIMS 系统。
Edge-AI 监控:连续发酵产 DNA 酶制剂过程中,边缘运算模块实时预测浓度曲线并调节补料量。
十二、结语
紫外吸收定量法以“最快速、最经济、最少样本损耗”的优势,仍是核酸研究与生产链条中不可或缺的基础工具。只要掌握 正确稀释、比值判读、杂质排查 三大关键,外加 微量光程 & 数据质控 两大加成,即可把 DNA 浓度测定误差控制在 ±2 % 以内,为下游实验提供坚实起点。随着 MEMS、AI 与 IoT 技术持续植入,紫外法将在未来的“智慧实验室”和“连续流生产”场景中焕发新的生命力。
