
赛默飞实时荧光定量 PCR 系统如何选择
选择赛默飞实时荧光定量 PCR 系统(qPCR 系统)时,需要根据实验室的具体需求、应用领域、样品通量以及预算等因素进行评估。赛默飞提供多款 qPCR 系统,每款设备在通量、灵敏度、功能和价格方面有所不同,因此选择适合的设备对于满足实验要求、提升工作效率和节约成本至关重要。
一、选择赛默飞 qPCR 系统时应考虑的主要因素
1. 实验通量
低通量实验室:如果实验室只需要进行少量样品的定量PCR分析,低通量的 qPCR 系统能够满足日常基因表达分析和病原体检测的需求。典型选择包括 QuantStudio™ 1。
中等通量实验室:如果实验室需要处理中等规模的样品数量,支持 96孔或384孔板格式的系统较为适合。这类设备能够满足基因分型、突变分析等较高通量的要求,适合科研和临床应用。典型选择包括 QuantStudio™ 3 和 QuantStudio™ 5。
高通量实验室:如果实验室需要处理大量样品,如基因组筛查和高通量基因表达分析,高通量设备能够同时处理多达数千个样品,极大提高工作效率。适合大规模研究和商业应用。典型选择包括 QuantStudio™ 6 Flex、QuantStudio™ 7 Pro 和 QuantStudio™ 12K Flex。
2. 荧光通道数
单靶标检测:如果实验只涉及单一基因或靶标的定量检测,2-4 个荧光通道的 qPCR 系统通常足够使用。例如 QuantStudio™ 1 和 QuantStudio™ 3 配备 2-4 个通道,适合常规基因表达或病原体检测。
多靶标检测:对于多靶标检测或需要进行多重PCR的实验,推荐选择 4-6 个荧光通道的 qPCR 系统。这类系统适合基因分型、突变检测等复杂实验。设备如 QuantStudio™ 5、QuantStudio™ 6 Flex 和 QuantStudio™ 7 Pro 都具备6个荧光通道,能够同时检测多个靶标。
3. 应用需求
基因表达定量:如果实验室的主要需求是定量分析基因表达,低到中等通量的 qPCR 系统即可满足需求,如 QuantStudio™ 1 或 QuantStudio™ 3。这些系统支持SYBR Green或TaqMan探针技术,灵敏度和可靠性高,适合基因表达分析。
突变检测和基因分型:若实验室需要进行突变检测或基因分型,选择具有多通道和高灵敏度的系统非常重要。QuantStudio™ 5 和 QuantStudio™ 6 Flex 等系统支持多重PCR,能够检测多个基因突变或进行 SNP(单核苷酸多态性)分析。
高通量筛查:对于大规模基因筛查或病原体筛查的需求,推荐选择能够处理高通量样品的系统,如 QuantStudio™ 12K Flex,能够一次处理多达12,000个反应,适合制药公司、核心实验室或需要大批量样品处理的研究机构。
4. 自动化和远程管理
自动化集成:如果实验室希望减少人工操作并提升实验效率,建议选择支持自动化样品处理的系统,如 QuantStudio™ 6 Flex 和 QuantStudio™ 7 Pro。这些系统能够与自动化液体处理设备集成,极大提升了样品处理的效率和一致性。
远程监控和数据管理:部分系统支持与 Thermo Fisher Cloud 集成,允许用户通过云平台进行远程监控、数据管理和实验协作。如果实验室分布在不同地点或需要远程访问实验结果,支持远程控制的系统将是理想选择,如 QuantStudio™ 7 Pro 和 QuantStudio™ 12K Flex。
5. 预算
入门级和小型实验室:对于预算有限的小型实验室或初学者,入门级的 QuantStudio™ 1 和 QuantStudio™ 3 系统提供高性价比的解决方案,能够满足大多数基础实验需求。
中等预算的实验室:对于具有中等预算的实验室,QuantStudio™ 5 是一款非常适合的设备,提供了多通道检测和更高的灵活性,能够应对复杂实验需求。
高预算实验室:如果预算较为充足且需要处理大量样品,推荐选择 QuantStudio™ 6 Flex、QuantStudio™ 7 Pro 或 QuantStudio™ 12K Flex 系统。它们支持高通量检测、自动化集成和远程监控,适合科研机构、大型实验室或制药公司。
二、赛默飞常见 qPCR 系统型号对比
型号 | 荧光通道数 | 样品格式 | 通量 | 应用 | 适用实验室 |
---|---|---|---|---|---|
QuantStudio™ 1 | 2 | 96孔板 | 低通量 | 基因表达定量、病原体检测 | 小型实验室、初学者 |
QuantStudio™ 3 | 4 | 96孔板 | 中等通量 | 基因表达定量、突变检测、SNP分析 | 中小型实验室 |
QuantStudio™ 5 | 6 | 96孔板、384孔板 | 中等通量 | 基因分型、突变检测、基因表达定量 | 中等通量实验室、科研院所 |
QuantStudio™ 6 Flex | 6 | 96孔板、384孔板、TaqMan Array | 高通量 | 基因筛查、基因表达定量、SNP分析 | 高通量实验室、药物研发 |
QuantStudio™ 7 Pro | 6 | 96孔板、384孔板、TaqMan Array | 高通量 | 基因分型、突变分析、高通量基因筛查 | 高通量实验室、核心实验室 |
QuantStudio™ 12K Flex | 6 | 96孔板、384孔板、TaqMan Array | 超高通量(12,000个反应/实验) | 基因筛查、大规模突变检测、CNV分析 | 大型实验室、药物研发、基因组中心 |
三、选择赛默飞 qPCR 系统时的建议步骤
明确实验需求:根据实验目标选择适合的应用(如基因表达定量、突变分析、基因分型等),并确认所需的荧光通道数和样品处理能力。
评估实验室通量要求:确定每天或每周需要处理的样品数量,以便选择适合的样品格式和系统通量。小型实验选择低通量设备,高通量需求选择支持384孔板或TaqMan Array的设备。
考虑未来扩展需求:如果实验室未来可能增加实验规模或需求,建议选择支持多种样品格式并能够灵活升级的系统,如 QuantStudio™ 5 或 QuantStudio™ 6 Flex。
结合预算做出决策:根据实验室的预算范围,选择性价比最优的设备,确保在不超出预算的前提下满足实验需求。
四、总结
赛默飞提供多款功能强大的实时荧光定量PCR系统,适合从低通量到超高通量的各种实验室需求。在选择合适的系统时,需结合实验室的样品通量、检测通道数、应用需求和预算,确保选择能够长期满足实验需求的设备。
